เซบาสเตียน อัลแลร์ เปิดตัวเป็นผู้เล่นให้เอฟซี อูเทร็คท์ สโมสรดังในเอเรดิวิชี่ลีก ด้วยสัญญายืมตัวจากโบรุสเซีย ดอร์ทมุนด์ จนกระทั่งจบฤดูกาลดาวยิงวัย 30 ปี ไม่มีที่ว่างในทีมเสือเหลืองจนถูกปล่อยยืมตัวไปเล่นให้เลกาเนส เมื่อสิ้นเดือนสิงหาคมที่ผ่านมา ก่อนที่สัญญายืมตัวของเขาจะถูกยกเลิกลง
ล่าสุด อัลแลร์ ได้สโมสรใหม่เมื่อตกลงย้ายกลับไปเล่นให้สโมสรเก่าที่เขาสร้างชื่อขึ้นมาอย่างอูเทร็คท์
อัลแลร์ เคยเล่นให้กับอูเทรฌคท์ ระหว่างปี 2015 ถึง 2017 ประสบความสำเร็จอย่างมากในช่วงแรกที่เขาอยู่กับสโมสร โดยทำไป 41 ประตูจากการเล่น 82 นัด ก่อนจะถูกดังตัวไปไอน์ทรัคท์ แฟรงเฟิร์ต ด้วยค่าตัว 7 ล้านยูโร
